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微流控流式细胞仪结合了微流控技术与流式细胞术，其技术原理主要基于微流控芯片对细胞的精确操控以及流式细胞术对细胞的多参数分析。
在技术原理方面，微流控流式细胞仪利用微流控芯片构建微米级通道，通过精确控制流体，使细胞以单列形式逐个通过检测区域。当细胞经过激光束时，会产生散射光和荧光信号。散射光信号包括前向角散射光（FSC）和侧向散射光（SSC），FSC反映细胞大小，SSC反映细胞内部复杂程度。荧光信号则是细胞被荧光染料标记后，在激光激发下发出的特定波长的光，可反映细胞表面或内部的特定分子信息。这些信号被光电探测器接收并转换为电信号，再经数据处理系统分析，从而实现对细胞的计数、分类和分选。
其发展趋势主要体现在以下几个方面：一是仪器小型化与集成化，微流控芯片的应用使仪器体积大幅减小，便于携带和现场检测，同时集成化程度不断提高，将多个功能模块整合在一个芯片上；二是多参数检测能力增强，能够同时检测更多种类的细胞特征参数，为细胞研究提供更全面的信息；三是检测灵敏度和准确性提升，通过优化微流控芯片结构和检测系统，提高对低丰度细胞和微弱信号的检测能力；四是与其他技术融合，如与单细胞测序技术结合，实现对细胞功能和基因信息的联合分析，推动生命科学研究向更深层次发展。
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