qPCR(实时定量PCR)仪是一种高灵敏度的分子生物学工具,能够对DNA或RNA进行定量、定性检测,广泛应用于科研、医疗、农业等领域。以下是qPCR仪常见的检测项目分类:
一、基因表达分析
1、mRNA表达水平:检测特定基因的转录水平,研究基因功能、信号通路、疾病机制等。
示例:癌症相关基因、炎症因子(如IL-6、TNF-α)、干细胞标记物等。
2、非编码RNA:如miRNA、lncRNA、circRNA的表达分析,用于表观遗传学研究。
二、病原体检测
1、病毒:快速定量病毒载量,如:
HIV、HBV、HCV(病毒性肝炎)
SARS-CoV-2
流感病毒(H1N1等亚型分型)
2、细菌:检测致病菌(如结核分枝杆菌、沙门氏菌、耐药菌基因)。
3、真菌/寄生虫:如白色念珠菌、疟原虫等。
三、基因突变与多态性分析
1、SNP(单核苷酸多态性):用于遗传病风险评估、药物代谢基因分型(如CYP450家族)。
2、突变检测:如癌症驱动突变(EGFR、KRAS、BRAF)、遗传病相关突变(囊性纤维化CFTR基因)。
四、转基因与食品安全
1、转基因成分(GMO)检测:如大豆、玉米中转基因序列的定量。
2、食源性病原体:如大肠杆菌O157:H7、李斯特菌等。
五、表观遗传学
1、DNA甲基化:通过甲基化特异性qPCR(MSP)检测启动子甲基化状态(如肿瘤抑制基因)。
2、染色质修饰:结合ChIP-qPCR分析组蛋白修饰。
六、环境与微生物组学
1、环境微生物:检测水体、土壤中的特定微生物(如降解污染物的细菌)。
2、肠道菌群:定量特定菌种(如双歧杆菌、拟杆菌)。
七、技术扩展
1、多重qPCR:同时检测多个靶标(需不同荧光标记探针)。
2、数字PCR(dPCR):更高精度的绝对定量,适用于低丰度靶标。
qPCR仪的高通量、高灵敏度使其成为分子诊断和基础研究的核心设备,具体项目需根据实验目的设计检测方案。
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