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蛋白质测序数据类型解析

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蛋白质测序数据类型解析检测技术服务详情介绍

蛋白测序通常指的是确定dànbáizhì的氨基酸序列。这涉及对dànbáizhì的氨基酸进行排序,以确定它们在dànbáizhì中的确切顺序。蛋白测序的数据结果可以描述为以下数据类型:


1、氨基酸序列:

这是dànbáizhì测序的主要输出,表示为一个由20种标准氨基酸单字母代码组成的字符串。例如,一个小的蛋白片段可能有序列“MGSDKI".

Edman测序研究案例

图1

2、质谱图数据:

如果使用质谱法进行dànbáizhì测序,会获得一个质谱图,显示了不同的质荷比和相对强度。这可以帮助确定氨基酸片段的质量和组成。

从头测序

图2

3、覆盖图或映射:

这显示了已经确定序列的dànbáizhì片段是如何映射回到整个dànbáizhì的。这可以帮助研究者了解已经确定了多少的dànbáizhì序列以及还有哪些区域尚未确定。

20221219-3038-肽段覆盖率3.png

图3


4、置信度得分:

对于每个确定的氨基酸位置,可能会有一个置信度得分,表明该位置的氨基酸标识的确信程度。


5、其他注释:

可能包括已知的翻译后修饰、亚单位信息、已知的结构域等。

通常,氨基酸序列数据可以存储在简单的文本格式中,如FASTA格式。而质谱图数据通常会保存在专门的格式中,如.mzML、.mzXML或.raw格式。

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