dànbáizhì组学是一门以dànbáizhì组为研究对象,旨在研究细胞、组织或生物体组成及其变化规律的学科。自从1975年O'Farrell和Klose等人建立双向凝胶电泳技术(2-DE)以来,2-DE技术凭借其高灵敏度和高分辨率、便于计算机进行图像分析处理、可以很好地与质谱分析等鉴定方法匹配等优点成为目前dànbáizhì组学研究的核心手段。
近年来,dànbáizhì组学的研究重点已从dànbáizhì的鉴定到量化转移。定量的dànbáizhì组学研究可定义为多个样品间dànbáizhì丰度相对差异的研究。尽管一些可选择的或互补的dànbáizhì组学技术正在发展,如同位素亲和标签和多维dànbáizhì鉴定技术,但双向电泳仍是当前仅有的可以同时分离大量的复杂的dànbáizhì混合物的关键技术。
传统的双向电泳2-DE在样品制备、电泳条件及凝胶染色等方面难以保证wánquán一致,因此容易产生胶间差异。这种差异会导致试验的重复性不佳,敏感度较低,甚至可能掩盖真实的生物学差异或产生误导性的假阳性结果。为了解决2-DE技术存在的缺陷,1997年Unlü et al提出了双向荧光差异凝胶电泳(Two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis,2D-DIGE)。
2D-DIGE 技术的原理是先用不同的荧光染料标记dànbáizhì样品,再使dànbáizhì变性,然后用固定pH梯度凝胶,根据dànbáizhì电荷差异分离出不同pH值的dànbáizhì带,再将此胶条置于含SDS 的聚丙烯酰胺凝胶上,根据dànbáizhì分子量加以分离,并通过多通道激光扫描分析不同dànbáizhì的SDS-PAGE凝胶图像。其主要步骤:用2种不同的荧光染料(Cy2、Cy3 或 Cy5)标记要比较的dànbáizhì样品;等量均匀混合荧光标记后的样品;使用相同的内标,将混合后的样品经双向凝胶电泳进行分离;在荧光显微镜下,用不同的激发波长来检测电泳结果。
图1. 2D-DIGE技术的一般流程
2D-DIGE相较于传统的2-DE具有的显著优势:
采用荧光标记技术,能同时比较多个样品,提高了实验效率和准确性。
由于荧光标记的引入,使得dànbáizhì的分离和检测更加jīngquè,可以检测到更细微的dànbáizhì差异。
引入了内标,更好地消除了试验的偶然误差,避免了不同凝胶之间的差异,极大地提高了结果的准确性和可信度。
不需要进行电泳后的固定或脱色过程,减少了dànbáizhì特别是低分子量dànbáizhì的损失。
荧光信号的数字化处理使得数据的获取和分析更加快速和准确。
百泰派克生物科技提供SDS-PAGE和2D-DIGE电泳服务,结合Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台与nanoLC-MS/MS纳升色谱,为广大科研工作者提供一站式dànbáizhì组定性及定量服务。
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