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代谢组学一般根据以下四个维度对代谢物鉴定的可信度进行划分:可靠的鉴定得到的化合物(1级),通过假定注释得到的化合物(2级),通过假定注释对化合物类别进行鉴定(3级)和未知化合物(4级)。1级鉴定需要将目标代谢物的两个或多个正交特性(如保留时间、m/z和碎片质谱)与在相同分析条件下观察到的真实化学标准品的相同特性进行比较。推定(第2级或第3级)注释基本上仅依赖于一个或两个特性,且通常基于对不同实验室收集的以及不同分析方法获得的数据的比较,而不是在相同分析条件下与真正的化学标准品的直接比较。 未知代谢物指可以反复检测到的但其化学身份尚未确定的小分子。这些化合物虽然尚未被鉴定和分类,但在代谢组学实验中仍可根据光谱数据进行区分和定量。在LC-MS实验中,一个未知化合物将由wéi yī的保留时间、一个或多个质量或一个特定的初级离子碎片模式定义。在NMR实验中,一个未知化合物将由化学位移的模式定义。未知物可能代表先前没有被识别的小分子,例如代谢的次级产物或罕见的外源性物质,或者它们可能由已建立的途径构成分子但无法分配到现有的NMR参考谱库或MS碎裂模式。 未知化合物的鉴定非常耗时且成本高昂,通常需要进行制备规模的分离以进行NMR研究,或大量的化学合成才能使用MS/MS进行结构比较。因此,大多数报告都集中于检测具有可用的真实商业标准品或至少存在于代谢物数据库中的代谢物,即分类为1级,2级和3级的代谢物。由于许多代谢物固有的不稳定性和需求的缺乏,仅有数千种商业分析标准品可用。然而,这些标准品和数据库中存在的代谢物仅占内源性代谢物很小的一部分。因此,对于代谢组学研究来说,有效的方法来排序、研究和zuì终鉴定非特征代谢物是非常重要的。未知代谢物的成功鉴定将对生物标志物的发现和组学研究产生重大影响。
为了鉴定代谢组学样品中的未知化合物,应区分不同类别的代谢物,具有相同可分辨公称质量(nominal mass)的,具有相同可分辨公称质量但分子式和同位素质量不同的,相同可分辨公称质量和同位素质量但化学结构不同的,都应该对其进行区分。例如,liàngānsuān和异liàngānsuān是结构不同的异构体,但是可分辨公称质量和同位素质量相同。此外,由于单一代谢物可以在质谱仪中检测到不同的衍生物种,所以正确地将不同的衍生物种分配给母体代谢物也是很重要的。例如,在氨基酸分析中,三甲基硅烷化(TMS)与氨基酸发生化学衍生反应会生成含有1、2或3个TMS基团的氨基酸,这些氨基酸都应属于同一母体氨基酸。 百泰派克生物科技结合NMR,LC-MS/MS和生物信息学分析法,提供基于质谱的识别未知代谢物的分析服务,可以准确鉴定复杂生物样品中的代谢物。百泰派克生物科技不断开发工具和数据库,期望能够实现以自动化的方式对所有代谢物进行真实和完整的鉴定。欢迎咨询!
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
※服务优势:
1.采用目前世界上优良的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;
3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;
4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;
5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;
6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
※服务优势:
1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;
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3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;
4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;
5.zhuānyè生物信息学分析,分析更系统准确。
百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
※服务优势:
1.技术优良,*技术空白
采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。
2.分析数量大,成本较低
单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。
1.公司采用ISO9001质量控制体系,zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;
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