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药物发现的关键步骤是靶点识别——即发现“可成药"的生物靶点,在确定靶点后,还必须对其进行验证以证明靶点与疾病表型之间的功能关系,同时确保安全性。药物发现的过程漫长且昂贵,但良好的靶点验证将提高开发有效药物并zuì终在临床取得成功的可能性。CRISPR-Cas9基因编辑技术的zuì新发展对药物发现产生了巨大影响,研究人员能够有意激活或抑制基因,以阐明和了解那些在疾病进展中发挥作用的细胞途径。它还可用于创建准确的模型,以更好地研究疾病表型并筛选小分子以快速识别众多潜在目标。
一旦识别出这些潜在的靶点,就可以利用质谱技术来研究潜在药物分子与其靶标dànbáizhì或代谢产物之间的相互作用,揭示药物如何与其靶点结合,以及这种结合如何影响细胞内的信号传递和代谢途径。通过结合高通量基因敲除技术和质谱分析,研究人员不仅可以快速地识别新的药物靶点,还能深入理解药物的作用机制,从而设计出更有效、更安全的治疗方法。
高通量基因敲除在药物发现中的应用
百泰派克生物科技(BTP)基于高通量基因敲除技术,结合高通量质谱平台,可以为您提供从基因敲除到药物靶点鉴定的一站式解决方案。我们优化的CRISPR/Cas9系统可实现人/小鼠细胞系、原代细胞、免疫细胞及iPS细胞的单/多基因敲除、移码突变和大序列敲除。BTP自建7大检测平台,拥有CNAS/ISO9001双重质量体系认证实验室,旨在为您提供zuì优质的科研服务,我们期待与您的合作,欢迎免费联系我们,了解更多服务详情!
服务优势
1)敲除效率保证:优化的CRISPR/Cas9系统,超过80%靶点敲除效率在70%;基因敲除后,我们采用Sanger测序和深度dànbáizhì组学技术对敲除效率进行双验证,双重保障数据的真实性。
2)多种基于靶标的药物靶点鉴定平台:我们依托高分辨质谱平台,结合亲和层析技术以及活性位点定向探针等技术,开发并验证了多种基于靶标的药物靶点鉴定平台,可满足不同的科研需求。
3)项目周期短:在进行基因敲除实验前,我们会对不同细胞中基因必要性及表达量进行分析,确保实验的可行性,降低实验失败风险;且无需针对客户的靶点设计预实验进行gRNA验证,大大缩短了项目周期。
4)一站式服务:BTP拥有丰富的组学服务经验以及zhuānyè的技术人员,可以根据您的需求定制zuì优的项目方案,您只需将您的实验目的告诉我们并寄送样品,BTP负责所有项目后续,包括样品处理、实验分析、数据分析和项目报告。
应用案例
1.全基因组 CRISPR-cas9 敲除筛选结合质谱技术确定 KRAS 突变结肠癌 MEK 抑制剂耐药性靶点
靶向 KRAS 通路是治疗结直肠癌(CRC)非常有前景的方法,但结直肠癌细胞能够耐受 MEK 抑制剂,使得 MEK 抑制剂在 CRC 患者中的临床试验结果不尽人意。因此,作者 在 MEK 抑制剂存在的情况下进行全基因组 CRISPR/Cas9 筛选,以鉴定在含有 KRAS 突变的 CRC 模型中通过 MEK 抑制而综合致死的基因。结果表明,GRB7 通过 RTK 途径使 CRC 细胞对 MEK 抑制剂产生主要耐药性。 GRB7 免疫沉淀物的质谱分析表明 PLK1 是 GRB7 的主要相互作用激酶。PLK1 和 MEK 抑制剂的组合在体外和体内协同抑制 CRC 细胞增殖并诱导细胞凋亡。zuì终,作者确定 GRB7-PLK1 是介导 RTK 的枢轴,导致 MEK 抑制剂耐受。该研究表明,在携带 KRAS 突变的 CRC 患者的临床治疗中,PLK1 是协同 MEK 抑制剂的一个有前景的靶点。
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图1. CRISPR 文库筛选,确定 RTK 通路参与 KRAS 突变结肠癌细胞的 MEK抑制剂耐药性
2.利用 CRISPR 高通量筛选下一代候选药物
jífēitìní和厄洛替尼是治疗非小细胞肺癌的有效药物,它们以表皮生长因子受体(EGFR)为治疗靶点,但是 EGFR 的获得性突变 C797S 阻止药物与 EGFR làoānsuān激酶结构域靶位点相互作用,使患者对这些药物治疗表现出耐药性。阿斯利康(Astra Zeneca)使用CRISPR-Cas9高通量基因敲除技术在癌细胞系中创建了jīngquè的 C797S 突变, C797S 细胞系模型的应用使药物筛选能够识别针对这种新突变的下一代化合物。
Thress, K., et al. Nat Med.
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图2. 获得性EGFR C797S突变介导的AZD9291获得性耐药性
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对dànbáizhì序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对dànbáizhì的氨基酸组成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服务。对于未知理论序列的dànbáizhì,提供基于从头测序法的dànbáizhì从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
※服务优势:
1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;
3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;
4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;
5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;
6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量dànbáizhì组学、靶向dànbáizhì组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种dànbáizhì组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。
※服务优势:
1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;
2.体内体外多种dànbáizhì标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;
3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;
4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;
5.zhuānyè生物信息学分析,分析更系统准确。
百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,zuì后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。
※服务优势:
1.技术先进,填补技术空白
采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。
2.分析数量大,成本较低
单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。
3.应用前景大
①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;
②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;
③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从zuì小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。
百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从dànbáizhì、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等zhuānyè服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。
1.公司采用ISO9001质量控制体系,zhuānyè提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;
2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;
3.业务范围覆盖dànbáizhì组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;
4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;
5.服务3000+企业,10000+客户的选择;
6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!
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